El entorno de Personal Java (PJAE) está basado en la API de PersonalJava, la cual difiere de J2SDK y JRE es su especificación. Aunque PersonalJava este creado con la API de Java como base, PJAE esta organizado por los subconjuntos específicos del dispositivo. La Máquina Virtual PersonalJava es entonces una versión compactada de la familiar Máquina Virtual Java (JVM), para poder encajar en la limitada capacidad de memoria de éstos dispositivos portables.
PJAE incluye librerías de clases que soportan tanto a la Máquina Virtual Personal Java como a la API de PersonalJava. Aunque cada instalación de PJAE esta hecha a la medida para cada dispositivo en específico, la interoperabilidad de aplicaciones y/o applets dentro de equipos con PJAE está garantizada siempre y cuando el código soporte la API. Pero si se incluye esta API, las librerías específicas del dispositivo, applets y aplicaciones con métodos específicos, la interoperabilidad no está garantizada.